Ľudské telo obývajú miliardy mikroorganizmov. Tieto mikroskopické organizmy tvoria takzvaný mikrobióm, ktorý sa nachádza v mnohých častiach ľudského tela: v pľúcach, slinách, žlčových a pohlavných cestách a nakoniec aj v zažívacom trakte.
Za normálnych podmienok je bakteriálna flóra v dokonalej symbióze s organizmom. V tomto symbiotickom vzťahu medzi ľudským telom a črevnou flórou poskytuje človek (hostiteľ) nestrávený materiál k udržaniu baktérií. Na oplátku plnia mikroorganizmy (symbionty) rôzne funkcie užitočné pre človeka. Keď bakteriálna flóra a organizmus žijú v dokonalej harmónii, hovoríme o eubióze.
V priebehu posledných dvadsať rokov sa vedci z celého sveta stále viac sústreďujú na objavovanie sily a dôležitosti mikrobiómu. Vďaka tomu bola lepšie pochopená jeho úloha v ľudskom tele.
V prípade mikroorganizmov gastrointestinálneho traktu sa vzťah vzájomnej symbiózy s ľuďmi prejavuje v možnosti usadiť sa v prostredí s konštantnou teplotou, bohatom na živiny. Na druhej strane , tento vzťah človeka s mikroorganizmami má pre ľudské telo symbiotické výhody. Mikroorganizmy, ktoré tvoria črevnú mikroflóru, umožňujú ľuďom získavať energiu z potravy ich metabolickou premenou. Ďalším kľúčovým prvkom je ochranná úloha. Baktérie črevného mikrobiomu podporujú správnu regulačnú funkciu imunitného systému prostredníctvom interakcií vo vnútri sliznice, chránia pred cudzími mikróbmi tým, že pôsobia ako hlavná línia odolnosti proti kolonizácii exogénnymi baktériami a obmedzujú nadmerný rast patogénnych baktérií.
Mikrobióm každého jednotlivca sa tvorí od narodenia a formuje sa nasledujúcich niekoľko rokov. Štúdie preukázali, že súbor mikróbov sa môže líšiť u každého človeka, pričom niektorí ľudia majú väčšiu škálu baktérií než iní. Rozdiely v rozmanitosti môžu súvisieť napríklad so stravovacími návykmi, užívaním určitých liekov, alebo aj inými faktormi. Stále viac údajov a výsledkov výskumu naznačuje veľký význam mikrobiómu na správne fungovanie ľudského tela a významný vplyv mikroflóry na celkové zdravie, či náchylnosť na rozvoj mnohých ochorení.