În corpul uman locuiesc miliarde de microorganisme. Aceste organisme microscopice alcătuiesc așa-numitul microbiom, care se găsește în multe părți ale corpului uman: în plămâni, salivă, tract biliar și genital sau în tractul digestiv.
În condiții normale, flora bacteriană este în perfectă simbioză cu organismul. În această relație simbiotică dintre corpul uman și flora intestinală, omul (gazda) oferă material nedigerat pentru a menține bacteriile hrănite și vii. În schimb, microorganismele (simbionții) îndeplinesc diverse funcții utile organismului. Când flora bacteriană și organismul trăiesc în perfectă armonie, are loc eubioza.
În ultimii douăzeci de ani, oamenii de știință din întreaga lume s-au concentrat din ce în ce mai mult pe descoperirea puterii și importanței microbiomului. Datorită acestui fapt, rolul său în corpul uman a fost mai bine înțeles.
În cazul microorganismelor tractului digestiv, relația de simbioză cu organismul uman se manifestă prin stabilirea la nivel digestiv a unui mediu cu o temperatură constantă și bogat în substanțe nutritive. Bacteriile care alcătuiesc microflora intestinală permit oamenilor să obțină energie din alimente, prin metabolizarea lor de către microorganismele microflorei.
Un alt element cheie este rolul protector. Bacteriile microbiomului intestinal promovează funcția de reglare adecvată a sistemului imunitar prin interacțiuni în mucoasă, protejând împotriva microbilor străini, acționând ca linie principală de rezistență la colonizare de către bacteriile exogene și limitând creșterea excesivă a bacteriilor patogene.
Deși microbiomul fiecărui individ se formează la naștere și se modelează în următorii câțiva ani, microbiomul fiecărui individ este compus diferit. Studiile au arătat că setul de microbi poate varia de la persoană la persoană, unele persoane având o varietate mai mare de bacterii decât altele. Variațiile de diversitate pot fi legate, de exemplu, de obiceiurile alimentare, de consumul anumitor medicamente sau alți factori. Din ce în ce mai multe date și rezultate ale cercetărilor indică marea importanță a microbiomului pentru buna funcționare a corpului uman și influența semnificativă a microflorei asupra sănătății generale și a susceptibilității la dezvoltarea multor boli.